Trường Đại học Ehime ban đầu có 3 khoa: Nhân văn và Khoa học, Giáo dục và Kỹ thuật; tất cả được hợp nhất từ trường quốc gia Matsuyama (thành lập năm 1919), trường đào tạo giáo viên quận Ehime (1876) và trường Niihama quận Ehime (1939). Ngày nay, trường đại học có 6 khoa và 5 trường đại học.

Chương trình học

Một chương trình học chọn lọc độc đáo là "Super Science Courses" (SSC), chỉ chấp nhận một số lượng nhỏ các sinh viên có tài năng. Học sinh được đào tạo thông qua các môn học có cấu trúc đặc biệt tập trung vào khoa học chuyên ngành. Sinh viên SSC sẽ vào học một trong ba khóa học: Khoa học Môi trường, Khoa học địa chất và Kỹ thuật y sinh. Học sinh của SSC có thể hoàn thành chương trình giáo dục đại học của họ trong vòng ba năm để nghiên cứu tại Đại học Ehime hoặc ở nơi khác.

Các trung tâm nghiên cứu nâng cao

Đại học Ehime là nơi hoạt động trong lĩnh vực khoa học và là nơi để các trung tâm đẳng cấp thế giới bao gồm Trung tâm giáo dục chính phủ quốc gia, Trung tâm Nghiên cứu Môi trường Biển (CMES) và Trung tâm nghiên cứu địa động lực (GRC). Các trung tâm nghiên cứu khác bao gồm Trung tâm nghiên cứu Công nghệ và Khoa học (CSTRC, dẫn đầu bởi nhà sinh vật học quốc tế nổi tiếng Yaeta Endo), Trung tâm nghiên cứu Y học Ehime, Trung tâm Nghiên cứu Văn hóa châu Á và Trung tâm Nghiên cứu không gian và tiến hóa Vũ trụ.

Các Khoa:

Khoa Luật và Thư của Aidai; Khoa Giáo dục; Khoa Khoa học; Trường Y khoa; Khoa Kỹ thuật; Khoa Nông nghiệp; Các trường đại học

Các trường thành viên:

Trường Đại Học Luật và Thư;

Trường đại học Giáo dục;

Trường đại học Y khoa;

Trường đại học Khoa học và Kỹ thuật;

Trường đại học Nông nghiệp.